1.质子泵抑制剂与铋剂合用
质子泵抑制剂与铋剂均是消化科常用的药物。质子泵抑制剂能阻断胃壁细胞微泌管膜上的质子泵，使氢离子排出受阻，口服后能迅速提高胃内pＨ值，提高抗菌药对幽门杆菌的除菌效果，临床多用于消化性溃疡的治疗。常用药物有奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、埃索美拉唑等。铋剂如枸橼酸铋钾则需要在胃酸的作用下，以铋盐的形式沉积于胃黏膜，保护溃疡面，并发挥抗幽门杆菌的作用。两者同时口服，铋剂会因为失去酸性环境而不能发挥有效功能，因此两者不宜同时口服。若必须同时应用时，应错开服药时间，以免影响疗效。
2.铋剂用于上消化道出血的治疗
各种因素引起的胃酸分泌过多导致胃黏膜的损伤是患者发生上消化道出血常见的病因之一。胃黏膜主要分布着大量管壁无平滑肌的毛细血管，因此一般作用于平滑肌细胞的血管止血剂效果较差，而使用抑酸剂则可收到较好的效果。其原理是凝血块在pＨ值小于５的胃酸中迅速被消化，抑酸剂通过提高胃内的pＨ值，促进血小板聚集，诱导血浆凝血功能，而达到止血效果。但是，在上消化道出血活动期间如果口服铋剂，可因在胃内形成硫化物而出现黑便，影响了对出血的评价；另一方面铋剂可能会影响抑酸剂的疗效，因此不适合用于上消化道出血的治疗。
3.生态制剂合用抗菌药
顽固性腹泻常与滥用抗菌药导致肠道菌群失调、条件致病菌大量繁殖有关。生态制剂是临床主要治疗药物之一。常用的活菌制剂有两类：一类制剂如地衣芽孢杆菌活菌胶囊等可以大量消耗肠道内氧气，造成厌氧环境，促使厌氧菌生长以利恢复菌群的平衡；另一类如双歧杆菌活菌胶囊、双歧三联活菌等药物则直接补充肠道正常菌群。活菌制剂原则上不与抗菌药合用，以免影响疗效。若必须同时应用生态制剂与抗菌药，可考虑应用死菌制剂，该类制剂不受抗菌药的影响。
4.氟哌酸合用制酸剂
肠道感染患者临床上常常表现为腹泻、便血、里急后重、粪便检查白细胞增多等。喹诺酮类药物抗菌谱广，常作为肠道感染首选口服用药。由于胃肠道的症状常常同时存在，部分临床医师常常将氟哌酸与制酸剂合用。然而，制酸剂可影响氟哌酸的吸收，使血药浓度下降，疗效降低。另外，铝碳酸镁也可以影响氟哌酸的吸收，应避免同时应用。
5.十六角蒙脱石合用抗菌药
十六角蒙脱石含天然双八面体蒙脱石微粒，能覆盖胃肠道黏膜增强黏膜屏障，起到螯合胆盐，清除致病菌及毒素，扶植肠道正常菌群，减少肠道敏感性等作用，为目前治疗腹泻的常用药物。抗菌药与之同时口服，可被十六角蒙脱石吸附而排除体外。同时，十六角蒙脱石在肠道可以形成保护膜，而影响抗菌药的疗效。若必须同时应用，应相隔２小时以上。
6.柳氮磺胺嘧啶合用抗菌药
柳氮磺胺嘧啶是治疗溃疡性结肠炎的常用药物之一。柳氮磺胺嘧啶口服后小部分在胃肠道吸收，其余未被吸收的大部分在回肠末端和结肠由肠道细菌分解成磺胺吡啶和５－氨基水杨酸。该药治病机制主要是通过５－氨基水杨酸抑制前列腺素的合成而发挥作用。若同时应用抗菌药将会使肠道细菌量减少，影响药物的分解，降低疗效。因此，柳氮磺胺嘧啶不宜与抗菌药合用。近年来应用的５－氨基水杨酸制剂因无需细菌分解直接发挥作用，因此可不受抗菌药的影响。
